经营性资产改革和管理办公室（经营性资产管理委员会办公室）是学校于2016年12月设立的负责校办产业创新发展战略研究、校办产业改革规划和校办企业经营性资产管理的直属机构，与学校经营性资产管理委员会办公室合署办公。2020年10月，根据学校《吉林大学关于调整和优化部分机关机构设置和职能职责方案》，科技园办公室挂靠经营性资产改革和管理办公室。

经营性资产改革和管理办公室、产业党委下设党委办公室、综合管理科、企业管理科、资产管理科、经资委事务科、集体企业科。

经营性资产改革和管理办公室、产业党委目前有《产业党委、经营性资产改革和管理办公室党政联席会议议事实施细则》《中共吉林大学产业委员会会议议事实施细则》、《经营性资产改革和管理办公室（产业党委）党政领导班子民主生活会制度》、《产业党委（纪委）印信管理办法》、《产业党委理论学习中心组学习制度》、《产业党委党支部党日学习制度》、《产业党委党费收缴细则》、《校办企业消防安全管理暂行办法》、《经营性资产改革和管理办公室关于选用审计、评估中介机构实施细则》、《经营性资产改革和管理办公室服务项目自行采购实施细则》、《经营性资产改革和管理办公室法律服务中介机构选用实施细则》、《经营性资产改革和管理办公室（经营性资产管理委员会办公室）印信管理办法》、《经营性资产改革和管理办公室财务管理规定》、《经营性资产改革和管理办公室（产业党委）考勤管理制度》、《经营性资产改革和管理办公室、产业党委档案室管理制度》、《经营性资产改革和管理办公室、产业党委档案管理细则》、《经营性资产改革和管理办公室、产业党委公务交通费用管理细则》、《经营性资产改革和管理办公室(产业党委)办公设备和办公用品管理制度》及各科室工作职责、工作流程等制度。

科技园办公室负责科技园的校地共建、管理和发展。下设项目企业科、综合科。 科技园办公室目前有《 科技园办公室领导班子集体议事决策制度》《科技园办公室领导班子会议制度》《科技园办公室“三重一大”制度实施办法》《科技园办公室关键岗位交流制度》《科技园办公室政务公开制度》《印章管理制度》《权力运行监督管理制度》《科技园办公室党风廉政建设制度》《科技园办公室档案管理暂行办法》《科技园办公室保密工作暂行规定》《科技园办公室综合治理管理规定》《科技园办公室消防管理办法》《科技园办公室网络信息安全管理办法》《吉林大学科技园大学生创业基地 入驻企业管理与考核暂行办法》及各科室工作职责、工作流程等制度。